“全民健康工程”的初步研究框架获得战略小组基本认可后，便从务虚的研讨，进入了艰巨的实证研究与方案细化阶段。这个课题，被高层寄予厚望，也承载了无数人对健康中国的期盼，其目标之宏大、涉及面之广、牵动利益之深，堪称前所未有。作为首席顾问和框架的主要提出者，刘智深知，这不再仅仅是纸上谈兵，而是要为一场深刻的、系统性的变革绘制尽可能精确的“施工图”。
战略小组化整为零，成立了数个专题研究小组，分头攻坚。刘智统筹全局，但将更多精力投入到他最熟悉也认为最关键的几个领域：基层医疗卫生服务体系重构、中西医真正融合的路径探索，以及“价值医疗”导向的支付与激励机制改革。他坚持，再宏大的工程，也必须从解决老百姓看病就医最直接、最现实的痛点入手，从夯实整个体系的“网底”开始。
第一站，他再次扎进了基层。 这次，他不再是泛泛的观察者，而是带着具体问题的“解剖者”。他选择了一个中等发展水平的县和该县下辖的一个乡镇作为深度调研点。一蹲就是半个月，吃住在卫生院，跟着村医巡诊，与县医院的医生一起查房，和医保局的工作人员一起核算数据，甚至坐在患者家属中间，听他们算一笔笔医疗账、交通账、误工账。
他看到，虽然新农合和城镇居民医保覆盖面很广，但实际报销比例、目录外用药、起付线等问题，仍让许多家庭因病致贫、返贫的风险高悬。他看到，县医院“虹吸”了全县最好的设备和人才，但乡镇卫生院门可罗雀，村医年龄老化、知识陈旧、待遇微薄，难以承担健康“守门人”的职责。他看到，中西医“并存”却未“融合”，县中医院在拼命追求西医化的设备和发展模式，而乡镇卫生院的中医科则日益萎缩，真正的适宜技术如针灸、推拿、中药验方，因收费标准低、医保报销限制多、缺乏绩效激励，而被边缘化。
“刘顾问，不是我们不想用中医方法，”一位头发花白的乡镇卫生院老中医向他诉苦，“看一个病人，望闻问切半小时，开个方子十几块钱，医保报销还有限制。同样的时间，开检查单、开西药，收入能翻几倍。绩效考核看的是业务收入、检查阳性率……我们也要养家糊口啊。”
“我们村卫生室，就我一个老头子了，”一位坚守山村四十年的老村医，指着墙角寥寥几种基本药物和一套磨得发亮的旧银针，“年轻人谁愿意来？来了也留不住。乡亲们有点头疼脑热还找我，稍微重点的病，都往县里跑。我也知道很多小毛病用点土方、扎两针就好，可上
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